Après avoir fini le jeu une première fois, vous débloquez un nouvel écran-titre représentant une vue tournante du village, que vous pouvez d'ailleurs manipuler via le stick analogique de votre manette. Dans la version GameCube, tous les scénarios sont accessibles depuis cet écran titre, tandis qu'un sous-menu "Extras" les rassemble dans la version PlayStation 2.

Vous pouvez recommencer le jeu depuis le début en chargeant votre dernière sauvegarde (si vous en avez faite une après le boss de fin), en option "new round" ("nouveau tour"). Cela signifie que vous avez à votre disposition dès le début de votre partie, tout ce que vous avez acquis lors de votre partie précédente (état de santé, argent, votre malette complète, trésors, documents, cartes au trésor, gilet tactique, bottle caps, upgrades de vos armes...).
Si vous passez par le menu pour démarrer une partie et non pas en chargeant une sauvegarde, que ce soit en mode normal ou en mode pro, vous reprenez tout à zéro.

En terminant le jeu une première fois vous débloquez le mode Pro. C'est tout simplement le mode difficile du jeu, dans lequel les ennemis sont plus agressifs, plus résistants et les munitions et soins se trouvent en nombre moindre. Par ailleurs, la tactital vest est indisponible dans ce mode de difficulté.
Tout ce qui a été acquis dans le mode normal est inaccessible en mode Pro (inventaire, armes, etc), il faut tout recommencer à zéro lorsqu'on y joue la première fois. En revanche, tout ce qui a été acquis sera disponible lors de la partie suivante en mode Pro.
Dans la version GameCube, terminer le mode Pro ne donne droit à aucun bonus, cependant, dans la version PlayStation 2, il donne droit à une arme supplémentaire exclusive à cette version, le PRL 412.

Ce mode est accessible une fois l'aventure principale terminée une première fois. Vous incarnez Ada Wong en costume militaire, sur l'île. Le but de la mission est de réunir 5 échantillons de Plagas pour le compte de Wesker et de rejoindre le point d'extraction. Pour davantage de précisions et un guide de jeu, rendez-vous dans la section Assignment Ada.
Une fois ce scénario terminé vous débloquez la Chicago Typewriter, utilisable dans le jeu principal (version GameCube) ou dans Separate Ways (version PS2).

Ce mode est accessible une fois l'aventure principale terminée une première fois. Vous incarnez au choix Leon, Ada, Hunk, Krauser ou Wesker dans les quatre maps disponibles. Le but du jeu est de faire du score, en obtenant minimum quatre étoiles avec chaque personnage vous débloquez le personnage suivant (au départ uniquement Leon est disponible), et lorsque vous avez obtenu cinq étoiles sur toutes les maps avec tous les personnages, vous débloquez une arme bonus utilisable uniquement dans le jeu principal : le Handcannon. Pour davantage de précisions et un guide de jeu, rendez-vous dans la section Mercenaries.

Ce mode est exclusif à la version PlayStation 2, il n'existe donc pas sur la version GameCube, et il est accessible une fois l'aventure principale terminée une première fois. Vous incarnez Ada Wong vêtue de sa robe rouge, au cours de cinq chapitres ayant lieu en parallèle de l'aventure de Leon. Ada dispose d'un couteau et de davantage d'armes que dans Assignment Ada, elle peut désormais ramasser des trésors et a accès au marchand. Vous pouvez également sauvegarder vos parties et garder vos gains lors de la partie suivante. Lorsque vous terminez ce mode vous débloquez la Chicago Typewriter pour le jeu principal. Pour davantage de précisions et un guide de jeu, rendez-vous dans la section Separate Ways.

Dans la version PlayStation 2, une galerie des vidéos vous permet de visualiser comme vous le souhaitez l'intégralité des séquences vidéo du jeu principal et de Separate Ways (les vidéos d'Assignment Ada sont exclues).

Dans la version PlayStation 2, vous pouvez consulter à tout moment les cinq rapports d'Ada, issus du scénario bonus Separate Ways, depuis la partie "Extras" du menu principal. La version vidéo et la version texte de chaque rapport sont disponibles.